18 października 2011 roku Trybunał Konstytucyjny ogłosił wyrok (sygn. akt SK 2/10) w sprawie dotyczącej zasad naliczania odsetek za zwłokę w spłacie zobowiązań podatkowych w przypadku gdy postępowanie prowadził urząd kontroli skarbowej.
Trybunał Konstytucyjny orzekł, że art. 31 ust. 1 ustawy z dnia 28 września 1991 roku o kontroli skarbowej w zakresie, w jakim wyłącza odpowiednie stosowanie art. 54 § 1 pkt 1 i 7 ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 roku - Ordynacja podatkowa, jest niezgodny z Konstytucją.
W przedmiotowej sprawie zastosowanie art. 31 ww. ustawy spowodowało naliczanie odsetek za zwłokę zarówno za okres trwania zabezpieczenia majątkowego jak i za okres przedłużającego się ponad 3 miesiące postępowania kontrolnego.
Zdaniem Trybunału, przyjęta zasada naliczania odsetek za zwłokę także za okres zabezpieczenia wykonania zobowiązania podatkowego na mieniu podatnika oraz za okres od dnia wszczęcia postępowania kontrolnego do dnia doręczenia decyzji organu pierwszej instancji, stawia podatników kontrolowanych przez organy kontroli skarbowej w gorszej sytuacji w porównaniu z sytuacją prawną podatników kontrolowanych przez organy podatkowe, w stosunku do których odsetki nie są za wymienione okresy naliczane.
Takie zróżnicowanie Trybunał uznał za nieuzasadnione i arbitralne. Organ przed którym toczy się postępowanie nie może decydować o naliczaniu lub nienaliczaniu odsetek od zaległości podatkowych. Realizacja celu, jakim jest pobranie podatku, nie może przy okazji naruszać innych wartości konstytucyjnych.